Comparison of two isothermal methods for SARS-COV-2 screening in Callao, Peru

  • William Cassa-Loaiza Dirección de Laboratorio de Salud Pública, Dirección Regional de Salud, Callao, Peru; Escuela Profesional de Tecnología Médica, Universidad Privada San Juan Bautista, Lima, Peru. https://orcid.org/0000-0001-9974-2810
  • Cinthya Vásquez-Velásquez Dirección de Laboratorio de Salud Pública, Dirección Regional de Salud, Callao, Peru; Laboratorio de Endocrinología y Reproducción, Facultad de Ciencias y Filosofía, Departamento de Ciencias Biológicas y Fisiológicas, Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Peru. https://orcid.org/0000-0002-3326-0437
  • Gustavo F. Gonzales Laboratorio de Endocrinología y Reproducción, Facultad de Ciencias y Filosofía, Departamento de Ciencias Biológicas y Fisiológicas, Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Peru. https://orcid.org/0000-0003-1611-2894
  • Carol Velasquez-Medrano Dirección de Laboratorio de Salud Pública, Dirección Regional de Salud, Callao, Peru. https://orcid.org/0000-0001-8290-6233
  • Kevin Fernandez-Delgado Dirección de Laboratorio de Salud Pública, Dirección Regional de Salud, Callao, Peru. https://orcid.org/0000-0002-3931-4053
  • Keyla Alvarez-Huambachano Dirección Ejecutiva de Salud de las Personas Dirección Regional de Salud, Callao, Peru. https://orcid.org/0000-0002-2248-9359
  • Henry Gamboa-Serpa Dirección Regional de Salud del Callao, Peru. https://orcid.org/0000-0002-6148-8308
  • Diego Fano-Sizgorich Laboratorio de Endocrinología y Reproducción, Facultad de Ciencias y Filosofía, Departamento de Ciencias Biológicas y Fisiológicas, Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Perú. https://orcid.org/0000-0001-7172-0521
Keywords: SARS-CoV-2, Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction, Molecular Diagnostic Techniques

Abstract

Objective: To compare the isothermal molecular screening techniques CPA and RT-LAMP, against the gold standard test, reverse transcription quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR), and to determine its agreement.

Materials and Methods: Paired comparative case-control study. For the evaluation of the CPA method, 70 cases and 130 controls were used, while for RT-LAMP, 30 cases and 70 controls were used. The sensitivity and specificity of both tests were calculated. Subsequently, the bias-corrected Kappa index was calculated by resampling.

Results: Both techniques have adequate and equivalent values of sensitivity (RT-LAMP: 82.8%, CPA: 83%) and specificity (RT-LAMP and CPA: 91.5%), as well as a high concordance (88%), and Kappa-index (0.72).

Conclusion: Both isothermal molecular screening techniques are suitable for SARS-CoV-2 screening, with a similar sensitivity and specificity.

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Published
2023-01-26
How to Cite
1.
Cassa-Loaiza W, Vásquez-Velásquez C, Gonzales GF, Velasquez-Medrano C, Fernandez-Delgado K, Alvarez-Huambachano K, Gamboa-Serpa H, Fano-Sizgorich D. Comparison of two isothermal methods for SARS-COV-2 screening in Callao, Peru. Acta Med Peru [Internet]. 2023Jan.26 [cited 2024Nov.24];39(4). Available from: http://54.39.98.165/index.php/AMP/article/view/2475
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